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由于口腔是呼吸、消化系统的共同通道，因此引起“口腔异味”的原因就非常多，口腔局部和全身许多因素都可以引起口臭。如牙龈炎、牙周炎、慢性鼻炎、鼻窦炎、气管、肺部感染、消化不良、胃炎、便秘、糖尿病、肝、肾疾病、甚至肿瘤等，另外进食大蒜、饮酒、吸烟也都可以造成口臭。
但是，引起“口腔异味”最主要的原因是人口腔内的大量细菌。我们的口腔内有大量的专门食用食物残渣和坏死组织内蛋白质的细菌。这些细菌分解出难闻的气体，其中最难闻的气体是硫化氢(类似臭鸡蛋的味道)和甲基硫醇(它有强烈的畜粪味，把它添加在天然气中作为漏气的提示)。而当口腔内缺乏空气时，细菌就会大量繁殖，产生难闻的异味。
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